کهکشان در آستانه‌ی نبردی بزرگ قرارگرفته و کلینگون و رومولان دو قدرت کهکشانی می‌خواهند مناطق آلفا و بتا را تصاحب کنند و به همین دلیل همه موجودات زنده در تمامی کهکشان درخطر انقراض هستند و تنها راه نجات آن‌ها یافتن رازی باستانی است. اگر می‌خواهید به‌عنوان فرمانده این نبرد به کهکشان خود خدمت کنید بازی Star Trek Fleet Command را نصب کنید و برای نبردهایی استراتژیک آماده شوید. در ضمن تنها راه پیروزی در نبردها اتحاد با سایر کاربران میلیونی بازی است.
اگر مایل بودید ناوگان قدرتمندتری داشته باشید می‌توانید به فروشگاه بازی مراجعه کرده و کشتی‌های خود را ارتقا دهید تا در مبارزه‌های بهتر عمل کنید.
